Om dit te bereiken, stelt het CZO regelgeving vast, zoals voor de erkenning van opleidingen, zorgorganisaties en opleidingsinstituten. Daarnaast houdt het CZO toezicht op opleidingen en organisaties, diplomeert en registreert ze zorgprofessionals, en biedt ze informatie en advies om haar doelgroepen te ondersteunen.
In 2024 heeft het CZO een nieuwe organisatiestructuur gekregen die bijdraagt aan de visie. In plaats van een raad van toezicht, is een bestuur opgericht, bestaande uit vier bestuursleden. De bestuursleden worden voorgedragen door NFU en NVZ. De directeur heeft vol mandaat van het bestuur en is verantwoordelijk voor de strategische doelen en dagelijkse gang van zaken in de stichting. Het bestuur en de directeur wordt bijgestaan door de secretaris CZO.
In 2024 is ook de raad van advies ingesteld. De raad van advies adviseert het bestuur van het CZO ten aanzien van het samenhangend en flexibel CZO-opleidingsstelsel. De adviezen van de raad van advies gelden als een zwaarwegend advies.
Het nieuwe organogram van het CZO ziet er als volgt uit:

Zwarte lijnen geven hiërarchische verbanden aan, stippellijnen geven inhoudelijk adviserende verbanden aan en groene lijnen geven inhoudelijke ondersteunende activiteiten aan.